V tej regiji je različica delta najbolj razširjena

Nacionalni laboratorij za zdravje, okolje in hrano (NLZOH) je objavil nove podatke o prisotnosti različic virusa SARS-CoV-2 pri nas. Vključeni so podatki, ki so jih pridobili s sekvenciranjem v obdobju od 27. junija do 4. julija. 

V tem obdobju so na novo potrdili 88 primerov različice alfa (B.1.1.7), od tega jih je 32 potrdil NLZOH, 56 primerov pa so potrdili na Inštitutu za mikrobiologijo in imunologijo (IMI). Različico delta so potrdili v skupno 66 vzorcih (14 NLZOH + 52 IMI). Na IMI so ob tem potrdili tudi genetsko različico delta+ v štirih vzorcih. 

NLZOH

Poleg omenjenih različic, je bil potrjen tudi en primer različice gama (IMI), medtem ko različic beta, eta, jota in kapa v obdobju od 27. junija do 4. julija niso potrdili. 

Skupno je tako do zdaj potrjenih 200 primerov različice delta in šest primerov različice delta+. Poleg tega je bilo do zdaj potrjenih tudi 29 primerov različice beta, 8 primerov različice gama in 10.727 primerov različice alfa. Različico eta so do zdaj skupno potrdili v 48 primerih, različico jota v šestih primerih in različico B.1.1.318 v 19 primerih. 

NLZOH

Največ primerov različice delta je bilo do zdaj potrjenih v osrednjeslovenski regiji, in sicer 30. Sledita goriška (8) in obalno-kraška regija (6). V omenjenih treh regijah so zaznali tudi primere različice delta+. Ta slika bi se lahko kmalu spremenila, saj v to še niso zajeti podatki o sekvenciranju vzorcev dijakov, ki so se vrnili z maturantskega izleta v Španiji. 

NLZOH

Na NLZOH od 21. junija v sekvenciranje vključujejo vse pozitivne vzorce PCR, ki imajo Ct vrednost manj kot 30. Pred to spremembo so sekvencirali 10 odstotkov pozitivnih vzorcev. Iz te sheme so sekvencirali 49 vzorcev, en vzorec pa po naročilu epidemiologa. Med 50 vzorci so potrdili štiri različice virusa, in sicer alfa (32 primerov), delta (14 primerov), C.36.3 (3 primeri) in C.36 (1 primer).

Različica C.36.3 je znana tudi kot C.36 s pridruženo mutacijo L452R in je s strani ECDC trenutno uvrščena na seznam različic, ki jih preučujejo. Vsi trije primeri omenjene različice so zaznali v obalno-kraški regiji. 

NLZOH

IMI je v zadnjem sekvenciranju obdelal 111 pozitivnih vzorcev, ki so bili odvzeti v 55 odstotkih primerov iz osrednjeslovenske regije, 14 % iz goriške regije, 7 % iz zasavske regije, 5 % iz obalno-kraške regije, po 3 % iz jugovzhodne, posavske in savinjske regije in 1 % iz pomurske regije. Enajst vzorcev je pripadalo osebam, ki imajo stalno prebivališče v tujini. 

V 50,5 odstotka vzorcev so potrdili različico alfa, v 46,8 odstotka primerov pa so potrdili različico delta. Poleg omenjenih različic so potrdili tudi en primer različice gam pri osebi, ki ima stalno prebivališče v tujini. 

IMI je od 24. februarja do 4. julija v sodelovanju z NIJZ sekvenciral 246 genomov SARS-CoV-2 po okužbi pri osebah, ki so bile cepljene. Od tega je bilo 117 oseb cepljenih s cepivom Pfizer, 3 osebe s cepivom Moderna, 123 oseb s cepivom AstraZeneca in 3 osebe s cepivom Janssen. 

Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo