Sai Baba je umrl zaradi odpovedi organov, potem ko je zadnji mesec zaradi težav s srcem preživel v bolnišnici v domačem mestu Puttaparthi. Njegova smrt je povzročila veliko žalost med njegovimi privrženci. V Puttaparthi so zaradi spoštovanja do Sai Babe zaprli trgovine in urade. Premier Manmohan Singh je njegovo smrt označil za "nenadomestljivo izgubo". Njegovo truplo bo dva dni na voljo za javno čaščenje.
Med njegovimi privrženci, bilo naj bi jih okoli šest milijonov, so najvidnejši indijski politiki, poslovneži in slavne osebnosti. Pripisovali so mu nadnaravne sposobnosti, med drugim ozdravitve ljudi, spominjanje preteklih življenj in materializiranje predmetov. Sai Baba je trdil, da je reinkarnacija svetnika Sai Babe iz Shirdija, ki je umrl leta 1918.
Eden njegovih največjih finančnih podpornikov je bil nekdanji lastnik verige lokalov Hard Rock Cafe Isaac Burton Tigrett, ki se je preselil v Puttaparthi in večino svojega bogastva podaril organizaciji Sai Babe. Ta je z njim zgradil in vodil številne šole in bolnišnice.
Sai Baba, ki je bil v javnosti poznan po svoji oranžni obleki in afro pričeski, se je leta 1993 uspel izogniti atentatu, ko so štirje oboroženi moški vstopili v njegovo stanovanje in ubili dva njegova sodelavca, preden jih je ustrelila policija.
