Nekateri ljudje imajo v očeh rahlo mišično neravnovesje, ki ga možgani običajno lahko brez težav odpravijo. S 3D filmi pa je za oči prišlo povsem novo doživetje, ki zahteva večji umski napor. Normalno obe očesi vidita pod rahlo različnim kotom in ko so informacije obdelane se to prevede v globinsko zaznavo.

Projekcija 3D filmov pa ni kalibrirana na enak način kot so oči, zato se morajo možgani še dodatno potruditi, da razvozlajo informacije, kar pa lahko pri nekaterih povzroči glavobol. Zlasti, če posameznik slabo zaznava globino.

Novejša oprema naj bi sicer premostila nekatere omejitve iz preteklosti, vendar nekateri še vedno menijo, da se tehnologija ne bo prijela, saj bo sprva zanimiva, a bodo ljudje ugotovili, da ni najbolj udobna.