V prvem polfinalu se bosta pomerila Domžale in Krka, v drugem pa Olimpija in Maribor. Prvi polfinalni tekmi bosta 5., povratni pa 12. aprila 2017. Finale bo konec maja 2017.

Krka, edini drugoligaš med najboljšo četverico, je do polfinala prišla prek Brežic Term Čatež, Rolteka Doba in velenjskega Rudarja. Domžale so na poti do polfinala izločile TKK Tolmin in Krško, Olimpija je bila boljša od Turnišča in Aluminija, branilec naslova Maribor pa od Kalcerja iz Radomelj ter Gorice.

Polfinalna para pokala Slovenije:

Domžale - Krka
Olimpija - Maribor